Gelelektroforese kan udføres i enten vandret eller lodret orientering.Horisontale geler er typisk sammensat af en agarosematrix.Porestørrelser af disse geler afhænger af koncentrationen af kemiske komponenter: agarosegelporer (100 til 500 nm diameter) er større og mindre ensartede sammenlignet med acrylamidgelporer (10 til 200 nm i diameter).Til sammenligning er DNA- og RNA-molekyler større end en lineær proteinstreng, som ofte denatureres før eller under denne proces, hvilket gør dem nemmere at analysere.Således køres DNA- og RNA-molekyler oftere på agarosegeler (vandret). Vores DYCP-31DN-system er et horisontalt elektroforesesystem.Denne støbte gelstøbeenhed kan lave 4 forskellige størrelser geler af forskellige gelbakker.