DYCP-31DN-systemet er et horisontalt elektroforesesystem. Ved vandret gelelektroforese støbes en gel i vandret orientering og nedsænkes i løbebuffer i gelboksen. Gelboksen er opdelt i to rum, hvor agarosegel adskiller de to. Som tidligere nævnt er en anode placeret i den ene ende, mens en katode er placeret i den anden. Den ioniske løbebuffer gør det muligt at skabe en ladningsgradient, når en strøm påføres. Derudover tjener bufferen til at afkøle gelen, som opvarmes, når en ladning påføres. Løbebufferen recirkuleres ofte for at forhindre en pH-gradient i at dannes. Vi har kamme i forskellige størrelser. De forskellige kamme gør dette horisontale elektroforesesystem ideelt til enhver agarosegelapplikation, inklusive undersøisk elektroforese, til hurtig elektroforese med små mængder prøver, DNA, undersøisk elektroforese, til identifikation, adskillelse og klargøring af DNA, og til måling af molekylvægten.
Under elektroforesen dannes en gel i en støbebakke. Bakken indeholder små "brønde", der rummer de partikler, du ønsker at teste. Adskillige mikroliter (µL) af opløsningen, der indeholder de partikler, du ønsker at teste, fyldes forsigtigt i brøndene. Derefter hældes en buffer, som leder elektrisk strøm, ind i elektroforesekammeret. Derefter anbringes støbebakken, der indeholder partiklerne, forsigtigt i kammeret og nedsænkes i bufferen. Til sidst lukkes kammeret, og strømkilden tændes. Anoden og katoden, skabt af den elektriske strøm, tiltrækker de modsat ladede partikler. Partiklerne bevæger sig langsomt i gelen mod den modsatte ladning. Der slukkes for strømmen, og gelen tages ud og inspiceres.